home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00502 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  33 lines
  1. ************************************
  2. * Ribosomal protein L32e signature *
  3. ************************************
  4.  
  5. A number of eukaryotic  and  archaebacterial ribosomal proteins can be grouped
  6. on the basis of sequence similarities. One of these families consists of:
  7.  
  8.  - Mammalian ribosomal protein L32 [1].
  9.  - Drosophila ribosomal protein RP49 [2].
  10.  - Trichoderma harzianum ribosomal protein L32 [3].
  11.  - Halobacterium marismortui ribosomal protein HL5 [4].
  12.  - A probable ribosomal protein (ORF D) from Methanococcus vannielii [5].
  13.  
  14. These proteins have 135 to 240 amino-acid residues. As a signature pattern, we
  15. selected a stretch  of  about  20  residues  located in the N-terminal part of
  16. these proteins.
  17.  
  18. -Consensus pattern: F-x-R-x(4)-[KR]-x(2)-[KR]-[LIVM]-x(3)-W-R-[KR]-P-x-G
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  21. -Last update: June 1994 / Text revised.
  22.  
  23. [ 1] Jacks C.M., Powaser C.B., Hackett P.B.
  24.      Gene 74:565-570(1988).
  25. [ 2] Aguade M.
  26.      Mol. Biol. Evol. 5:433-441(1988).
  27. [ 3] Lora J.M., Garcia I., Benitez T., Llobell A., Pintor-Toro J.A.
  28.      Nucleic Acids Res. 21:3319-3319(1993).
  29. [ 4] Arndt E., Scholzen T., Kroemer W., Hatakeyama T., Kimura M.
  30.      Biochimie 73:657-668(1991).
  31. [ 5] Auer J., Spicker G., Boeck A.
  32.      J. Mol. Biol. 209:21-36(1989).
  33.